《虎口拔牙》的故事梗概主要围绕一个意外事件展开。故事开始于1945年的上海，牙医王天桥原打算离开上海去内地躲避战火。然而，在街头他意外地遇到了被日军特高课追捕的中国特工“田鼠”。在临被捕前，“田鼠”巧妙地将一个微型胶卷塞进了王天桥的口袋，这个胶卷蕴含着一个名为“智齿计划”的重要机密。
随后，故事引入了中学地理教师潘慎之，他因面貌酷似“田鼠”而遭遇了一系列麻烦。不久，王天桥和潘慎之的命运交织在一起，他们与王的妻子陈丹凤、潘的房东阿金等人都被卷入这场风波，成为不是特工的特工。
这群平民百姓在与各方势力多次周旋后，终于与中共地下组织接头，并成功地破译了胶卷中的机密。然而，“智齿计划”的另一部分已被日本特务机关掌握，他们不得不齐心协力破除敌人的圈套，智取另一部分。在经历了一系列波折后，他们欣喜地获得了第一件珍贵文物，但此时风中传来了日本投降的消息，抗日战争终于取得了胜利。
整个故事充满了紧张刺激的情节和意想不到的转折，展现了平民百姓在战争年代的智慧与勇气。通过这个故事，读者可以感受到那个时代人们的坚韧与不屈，以及为了国家和民族的利益而付出的巨大努力。